昭和30年12月 現病院の前身「日吉診療所」として創立。
昭和33年1月 日吉診療所を発展解消し、日本で最初の男女混合全開放の精神科単科病院としてスタート。初代院長、熊田正春。
平成5年1月1日 第二代院長、熊田隆夫就任。
平成25年1月1日 第三代院長、熊田貴之就任。
平成28年10月1日 第四代院長、伊川太郎就任。
令和4年4月1日 入院病床を廃止し、外来診療のみに方針を転換。
病床廃止に伴い、「日吉病院」から「日吉心療所」へと名称変更。
令和5年12月1日 診療所の拠点を「日吉」から「元住吉」に変更。
「日吉心療所」の名称を残しながら元住吉に移転。